La predizione della struttura secondaria delle proteine è fondamentale per comprendere la loro funzione e accelerare la scoperta di farmaci. Un nuovo studio presenta MOGP-MMF, un framework di programmazione genetica multi-obiettivo che affronta questa sfida come un problema di ottimizzazione automatica.

Architettura di MOGP-MMF

MOGP-MMF introduce una strategia di rappresentazione multi-vista e multi-livello, integrando viste evolutive, semantiche e strutturali per catturare la logica di ripiegamento delle proteine. Il framework evolve funzioni di fusione lineari e non lineari, catturando interazioni di alto livello tra le consegne e riducendo la complessità della fusione.

Ottimizzazione e risultati

Un algoritmo GP multi-obiettivo migliorato incorpora un meccanismo di trasferimento di conoscenza, utilizzando l'esperienza evolutiva pregressa per guidare la popolazione verso gli ottimi globali. Test approfonditi su sette dataset di riferimento dimostrano che MOGP-MMF supera i metodi allo stato dell'arte, in particolare in termini di accuratezza Q8 e integrità strutturale. Il codice è open source.